发烧的时候浑身疼关节疼，是因为发烧以后调动机体的免疫功能，引起机体的炎症反应。主要是前列腺素这种物质，可以触发机体的炎症反应，增加对疼痛的应激能力，所以会出现关节疼痛。首先治疗需要先查清是细菌性炎症还是病毒性炎症引起的，针对不同的病因，采取不同的药物，比如抗生素或抗病毒的药物，同时最主要的是要把体温降到正常，口服解热镇痛的药物，比如对乙酰氨基酚或尼美舒利胶囊，同时多喝水、注意保暖、注意休息。当体温逐渐降到正常以后，浑身的疼痛也会明显的好转。如果反复发烧，到医院化验一下血常规和C反应蛋白，看一下炎症的程度。