结膜炎一般根据结膜炎感染的类型，使用相应的药物治疗：第一，结膜炎是由细菌感染所引起的，一般眼睛局部点用抗生素类的滴眼剂，如左氧氟沙星滴眼剂，妥布霉素滴剂等，口服药物可以用头孢呋辛酯片，阿莫西林胶囊，头孢克肟胶囊等。第二，结膜炎如果是病毒感染所引起的，眼睛结膜局部点用抗病毒类的滴眼剂，如更昔洛韦滴眼剂，阿昔洛韦滴眼剂，夜间可以使用更昔洛韦眼用凝胶，可以口服阿昔洛韦片，利巴韦林颗粒，病毒灵等。病情严重可以静脉滴注抗病毒类药物如阿昔洛韦，利巴韦林。第三，结膜炎如果是真菌感染所引起，一般是局部点用那他霉素滴眼剂，氟康唑滴眼剂局部使用，口服药物使用伊曲康唑，酮康唑等进行抗真菌治疗。患结膜炎以后，要及时到医院诊断，明确根据致病菌采取相应的治疗措施。