临床上并不是所有的大三阳携带者都需要治疗的，如果大三阳携带者肝功能、肝彩超和肝纤维化扫描都是正常的，即使病毒量较大目前也没有必要治疗，因为目前是处于免疫耐受期。如果大三阳开始出现肝功能异常，同时伴有病毒量增高可以考虑抗病毒治疗，如果体质较好没有肝硬化，且病毒量在10^6以下，能经得注干扰素的副作用者可以先选择干扰素治疗。如果病毒量>10^7，乙肝表面抗原数值>10000者建议先口服核苷类药物，如恩替卡韦或替诺福韦等。待乙肝DNA转阴、乙肝表面抗原下降至1500左右时再联合或者序贯使用干扰素治疗，就能够加快大三阳转为小三阳，并且有7%左右的机率能够使乙肝表面抗原转阴。