肛门肿痛可以吃止痛的药物，如果是由于局部感染引起来的，还可以吃抗生素药物。肛门肿痛最常见的原因是由于发生肛门周围的脓肿，或者是有直肠粘膜下脓肿的情况。另外，也不排除是由于肛门周围的皮脂腺，或者是毛囊发生感染。建议患者先到肛肠科进行就诊，通过肛门局部的检查就可以明确诊断，在诊断明确以后通过药物的对症治疗，或者是手术进行治疗。如果是肛门周围的脓肿要进行根治性手术治疗，在手术之后按时进行换药，促进术后伤口的愈合。