肛门起了个水泡，先要查明引起水泡的原因，再给予相应的治疗。1、肛门的水泡是由多方面的原因导致的，如果是肛门尖锐湿疣形成的水泡，可以应用液态冷冻、激光或者手术的方式将疣体去除，再结合应用干扰素治疗。2、肛周脓肿形成的水泡，要进行手术切开排脓，将脓包里面的脓液清理干净，做好局部的引流，静脉滴注抗生素抗感染治疗。3、痔疮形成的水泡，可以用高锰酸钾坐浴，肛门内塞痔疮栓、涂抹痔疮膏，必要时进行手术治疗。