清除钻木蜂可用30%乙酰甲胺磷，40%乐果乳油对建筑物周围的花草喷药，防治前来采蜜的木蜂。也可用棉花浸取80%敌敌畏乳油，塞入被木蜂钻蛀的孔洞，然后用黄泥浆封塞洞孔或使用阿维菌素或灭幼脲与黄泥搅拌混合堵塞蛀孔，杀死洞内幼虫、成虫。如果条件允许，还可以在梁柱的外面刷一遍油漆，以赶走木蜂。