在临床上判断是不是肛瘘，主要是要找到内口以及外口，现在临床上判断肛瘘的方法比较多，比如说：第一，可以进行盆腔的核磁共振，核磁共振可以明确肛瘘瘘管的走形以及肛瘘内口的大概位置，基本上可以判断肛瘘的存在，除此以外还可以判断肛瘘是高位还是低位，是单纯还是复杂。第二，进行指针探查，如果指针从外口进入，从内口出来，这种情况就可以判断肛瘘。第三，进行造影检查。如果造影可以明确内口以及外口，也可以判断肛瘘。