与细胞呼吸有关的酶都是呼吸酶。细胞内的呼吸酶一部分由细胞质中游离的核糖体合成，一部分由线粒体自己合成。呼吸酶包括与有氧呼吸有关的酶和与无氧呼吸有关的酶，有氧呼吸时，通过呼吸链传递电子和氢离子产生ATP，而呼吸链就是由各种酶组成。无氧呼吸是指细胞在无氧条件下，通过酶的催化作用，把有机物质分解成为不彻底的氧化产物，同时释放出少量能量的过程。酶在呼吸过程中起着很重要的作用，在有氧呼吸和无氧呼吸中，有些酶是共用的。