肛窦炎分为慢性和急性。慢性肛窦炎无明显症状，或者是症状较轻，常表现为肛内隐痛，肛管有下坠感，排便时有轻痛或者是不适感，这种感觉往往持续时间较短，而急性肛窦炎表现为排便不尽感，肛门发胀，肛管有下坠感疼痛，肛门瘙痒等症状。疼痛在排便时可加重，呈刺痛和撕裂样疼痛，严重的还可以导致臀部、会阴部等邻近区域的疼痛，还可以引起排尿不畅，可能会伴有脓性或者是脓血性的分泌物。排便时肛门疼痛，而且定位十分明确，以肛门后位多见。其常伴随症状，伴发肛门乳头的炎症及增生肥大，还可以引起，如肛周脓肿，肛瘘，肛裂，肛乳头纤维瘤等肛门直肠疾病。