菌血症的治疗原则是在抗感染治疗之前，一定要明确患者身上是否有需要外科去除的感染病灶。如果有外科需要去除的感染病灶，一定要请相关的科室积极的处理，比如关节腔积脓、脓胸等均需要穿刺引流；此外，还要给予积极的抗感染治疗，往往菌血症抗感染治疗需要广谱，在起初没有获得病原学依据的时候，需要广谱、全覆盖，同时还要尽早完善痰培养、血培养、中段尿培养等来明确治病菌，并根据药敏试验的结果来调整抗生素的治疗方案。另外，菌血症的患者还需要加强对症支持治疗。