男人小便时疼常常提示有急性尿道炎，病人发生尿道炎时，由于有潜伏期，常常开始出现尿痛症状，随后出现尿道发痒和尿道外口分泌物。当病人出现大量分泌物时，需要及时到泌尿外科就医。通过分泌物检查常常能找到致病微生物，通过选择有效的抗生素，如阿莫西林分散片、阿奇霉素分散片、头孢克洛缓释片、磷霉素氨丁三醇散等，序贯治疗4-6周左右，再配合中成药物治疗，多数病人小便时疼症状会得到彻底治愈。