如果是一侧扁桃体疼痛，需要从以下几个方面来分析。1.炎症性疾病。最常见的就是急性扁桃体炎或者慢性扁桃腺炎。扁桃体左右各一，有时候扁桃体是双侧同时发炎，也有时候是单侧发炎。这种情况需要结合血常规等生化检查了解感染的程度和指标。治疗方面需要使用抗生素抗炎治疗，推荐二代头孢或者阿莫西林克拉维酸钾，再配合糖皮质激素消肿，非甾体类的消炎止痛药止痛对症处理。2.肿瘤性疾病。扁桃体的肿瘤比较常见的就是鳞状细胞癌。扁桃体鳞状细胞癌一般单侧发病，主要的临床表现就是咽喉疼痛或者扁桃体表面有溃疡，出血，这种情况需要行扁桃体活检以明确病理性质。治疗方面需要以手术治疗为主，辅助术后的放化疗。