马自达三厢和两厢区别在：
1、两厢马3是世界一流的日本马自达防府车厂制造，系原装进口轿车；三厢马3是我国长安马自达公司制造，系合资轿车。通常，原装进口车的品质和质量好于合资车；
2、三厢马3整车技术、性能是马自达“上一次改进的”，两厢马3是在三厢马3基础上“这一次改进的”。因此，两厢马3是三厢马3的改进、升级型；
3、不过，两厢和三厢的发动机与变速器是一样的，主要部分车身与底盘不一样，油耗，两厢自动挡在比较拥挤的城市里行驶，1.6的8.6升左右，2.0的9.2升左右。