胆汁反流的原因主要和慢性胆道疾病、幽门功能失常、胃肠神经肽、胃十二指肠动力紊乱和激素水平异常，还有某些类型的手术以后所造成的解剖异常等因素有密切关系。胆汁反流首先可以考虑进行药物治疗，常用的药物有胃动力药物、胃黏膜保护剂，结合胆盐药物、制酸剂，同时还应当注意根治就门螺杆菌感染。