依细菌或真菌感染而定毛囊炎最常见的是细菌感染毛囊部位之后引起的炎症，也有一些是真菌感染所引起，比如糠秕孢子菌性毛囊炎。治疗上完全不同，对于细菌感染引起的毛囊炎，可以选择广谱抗生素，配合外用的抗炎药膏，也可以做细菌培养，然后做药敏试验，有针对性的治疗效果会更好。对于糠秕孢子菌性毛囊炎，它是真菌感染引起，治疗需要口服伊曲康唑，外用比如硝酸舍他康唑或者萘替芬酮康唑乳膏等。真菌感染引起的毛囊炎，如果使用抗细菌药物，则没有效果。