化疗在临床上主要是针对恶性肿瘤而言的，其中包括癌症、肉瘤，以及来源于骨髓造血系统的恶性肿瘤。根据肿瘤发病的部位，其中包括脑部恶性肿瘤，以及头颈部恶性肿瘤，另外呼吸系统消化系统，以及妇科系统、生殖系统、泌尿系统的肿瘤，都是可以进行化疗的。对于大部分实体性的肿瘤，在临床上主要是手术为主的治疗方式。对于发生于骨髓造血系统的肿瘤，包括白血病、淋巴瘤，以及骨髓瘤，主要选择的是化疗为主的治疗方法，部分恶性肿瘤可以联合靶向药物治疗。