输尿管的结石可用吲哚美辛栓，抑制前列腺素的合成，减弱输尿管的收缩性，降低肾虚压力，减轻疼痛症状。疼痛持续不能减轻，应用麻醉类镇痛药物，例如哌替啶。在应用药物期间联合应用解痉止痛的药物，例如阿托品、硝酸山莨菪碱等等。肾结石止痛处理只能改善症状。根本性的治疗需要进行肾结石的碎石术，将结石粉碎后排出体外，可应用体外冲击波碎石。必要的情况下需要通过经皮肾取石的办法进行处理。