肛门镜检查时，患者取左侧卧位，双下肢向腹部屈曲，暴露肛门部。医生戴手套，选择合适的肛门镜，将肛门镜尖端涂抹石蜡油。食指在肛缘轻轻按摩，使患者放松肛门，嘱患者深呼吸，将肛门镜朝脐方向轻轻插入肛门。当肛门镜通过肛管后改向骶尾方向推入，直至肛门镜全部插入直肠壶腹内，观察直肠黏膜的颜色，是否有出血和脓苔。再轻轻向外，观察齿线处是否有内痔、是否有出血。肛窦处是否有炎症、是否有肥大肛乳头等。然后退肛门镜到肛缘处，会有不适感，完成肛门镜检查。