肝性脑病可以用新霉素、甲硝唑、利福昔明、乳果糖、氟马西尼、L-鸟氨酸-L-门冬氨酸等药物治疗。氨中毒和神经递质传导异常是引起肝性脑病的重要发病机理。因而，肝性脑病患者可以口服抑制肠道细菌生长，减少氨生成的抗菌药物，比如新霉素、甲硝唑、利福昔明等，也可以服用乳果糖来达到相同的治疗效果同时防治便秘。应用降氨药物L-鸟氨酸-L-门冬氨酸和调节神经递质药氟马西尼也可以改善症状。对于严重的肝性脑病患者，肝移植是一种有效的治疗方法，能够大大提高患者的生存率。