指甲出现凹陷，原因如下：1、甲真菌病即灰指甲，由皮肤藓菌侵犯甲板及甲下组织所引起，表现为甲变色、无光泽、增厚，破损表面可出现凹凸不平的凹陷点，真菌镜检为阳性；2、甲营养不良，甲营养不良是一种多因素引起的甲损害，常累及所有的指甲，导致指甲浑浊变形、易碎，表面失去光泽，粗糙，也可以出现凹陷，但是真菌镜检往往为阴性；3、慢性的皮肤病，如银屑病、扁平苔藓、慢性湿疹，也可以导致指甲表面出现凹陷。当指甲出现异常，患者应该到正规医院的皮肤科找专科医生鉴别。