食品健康证的电子版一般在申请后的2-3个工作日内可以出来。具体时间还要看当地食品药品监督管理部门的工作效率。申请人可以通过监管部门的官方网站或移动端APP查询电子版证书的状态。如果超过3个工作日还没有出来电子版证书，建议申请人联系当地的食品药品监督管理部门咨询处理进度。