抗甲状腺药物，经胃肠道吸收进入血液。甲巯咪唑和丙硫氧嘧啶是常用的抗甲状腺药物。两者口服后经胃肠道吸收进入血液，但药物的半衰期不一样。丙硫氧嘧啶较短仅为60分钟，而甲巯咪唑较长为4~6个小时，所以丙硫氧嘧啶需要每隔8小时服用，而甲巯咪唑可以每日一次服用。甲巯咪唑的抗甲亢作用是丙硫氧嘧啶的10倍，所以一般甲亢可首选甲巯咪唑治疗。此外药物在血液中必须与蛋白质结合在一起运输，由于丙硫氧嘧啶与蛋白质结合较甲巯咪唑紧密，丙硫氧嘧啶相对不容易通过胎盘和乳腺，因此到达胎儿，血液和乳汁中相对较少，所以对于甲亢合并妊娠或者哺乳妇女应该首选丙硫氧嘧啶治疗。此外丙硫氧嘧啶还具有抑制外周组织中T4向T3转换的作用，因此甲亢危象时应该首选丙硫氧嘧啶治疗。