肾脏结石合并有同侧的肾脏囊肿，原则上不能进行体外冲击波碎石，但是还要看结石位置和囊肿大小。如果囊肿的体积较大超过4cm以上，在体外冲击波碎石的过程中可能会造成囊肿破裂，造成局部疼痛或者出血等。所以对于同一侧肾脏的结石合并有超过4cm以上的囊肿，不能进行体外冲击波碎石。如果同侧肾脏的结石合并囊肿，其体积较小，小于1cm以下，可以进行体外冲击波碎石。但在碎石前要告知可能有囊肿自行破裂的风险，碎石以后患者需要进行观察有无腰痛或者有严重血尿等。如果囊肿介于1-4cm之间，囊肿和结石不在同一层次或者同一平面，可以酌情考虑体外冲击波碎石。但是如果在碎石机上观察，结石与囊肿重叠或者重合或者处在同一平面，不建议进行体外冲击波碎石。