对于炎症性肠病性关节炎治疗原则是：缓解关节症状、保护关节功能、延缓病情进展和防止关节破坏，其治疗主要是药物治疗。对炎性肠病性关节炎的治疗取决于肠道受累的范围和程度，必须适当考虑整个临床情况和疾病的慢性特征进行治疗。可应用糖皮质激素，有利于病情缓解，但是不能用于维持治疗。因为该类药物不能防止肠病的复发，一般可使用泼尼松，待病情缓解后递减药量，维持半年以上。病情严重者可用氢化可的松或者地塞米松，病情缓解后改为泼尼松口服。对于慢性反复发作的肠病患者，应加用免疫抑制剂，可使病情改善和缓解，但要注意药物的毒副作用。通常在维持使用糖皮质激素的基础上，加用免疫抑制剂联合治疗，可减少两药的剂量和副作用。治疗炎性肠病性关节炎并不能阻止关节进行性钙化和融合的发生，因此需要针对病变关节给予理疗和抗炎药物的治疗。