肺部小结节病的治疗主要根据病因而给予具体的治疗。肺部小结节常见于肺部的炎性结节、肺结核、肺结节病、肺癌、肺曲霉菌病以及肺隐球菌病。对于肺部小结节的的患者，可以行穿刺活检以明确病变的性质。对于确诊的患者可以根据病因给予相应的治疗。考虑炎性结节的患者，可以给予敏感的抗生素治疗；考虑是肺结核病的可以给予抗结核药物治疗；如果是肺结节病的患者，可以给予糖皮质激素以及免疫抑制剂治疗；如果考虑肺隐球菌病以及肺曲霉菌病的患者，可以给予抗真菌的药物治疗；如果考虑肺癌的患者在早期可以考虑手术治疗。