通常磷酸西格列汀片的缺点主要是：部分患者服用会产生不良反应，比如胃肠道的刺激，出现腹胀，恶心，呕吐，腹痛，腹泻等。另外还可能会导致出现有胰腺炎，部分患者使用之后还可能会发生超敏反应，包括过敏反应，血管性水肿，荨麻疹，皮肤血管炎以及剥脱性皮肤损害，还可出现有肝功能的减退出现转氨酶的升高，甚至会发生急性肾功能衰竭，还可引发上呼吸道感染，鼻咽炎，便秘，头痛，关节痛，肌肉痛。一般不建议在18岁的人群中使用，而且对这个药物过敏的患者是禁止服用。