人与自然的深层次矛盾日益显现，主要体现在以下几个方面：

1.资源的过度开发和消耗：人类为了满足自身的需求，不断地开发和消耗自然资源，导致资源的枯竭和环境的破坏。例如，过度的石油开采导致了严重的环境污染和气候变化。

2.生态系统的破坏和失衡：人类的活动对生态系统造成了严重的破坏和失衡，导致生物多样性的丧失和生态系统的崩溃。例如，乱砍滥伐、过度放牧等行为导致了森林的破坏和草原的退化。

3.污染和环境破坏：人类的生产和生活活动产生了大量的污染物和废弃物，导致了环境的破坏和生态系统的失衡。例如，工业废水和废气的排放导致了水源和空气的污染，严重影响了人类的健康和生存环境。

4.气候变化和自然灾害：人类的活动对气候产生了重大影响，导致了全球气候变化和自然灾害的频繁发生。例如，温室气体的排放导致了全球气温的上升和海平面的上升，加剧了自然灾害的发生。

综上所述，人与自然的深层次矛盾日益显现，主要是由于人类的活动对自然环境的破坏和失衡所导致的。如果不及时采取有效的措施，将会对人类的生存和发展造成严重的威胁。