生理期头痛往往以偏头痛最为多见，称为月经性偏头痛。对于月经性偏头痛的治疗，主要是采用发作期治疗和预防性治疗，发作期治疗可以使用阿司匹林、对乙酰氨基酚、曲普坦类药物进行治疗。对于每一次月经期前均有发作的女性患者，可以采用预防类药物进行治疗，如妥泰、西比灵等药物。月经期偏头痛可能与激素变化有关，在月经前后，血清中的雌二醇浓度降低，引起颅内外的血管及子宫血管对某些因素，如5—羟色胺等物质更加敏感，引起血管张力的变化，因此出现偏头痛发作。