龟头起水泡，首先是要分清病因，然后再针对性的治疗。一般来讲，比较常见的是龟头部位的生殖器疱疹，这是单纯疱疹病毒感染所引起的，可以及时地内服抗疱疹病毒的药物，比如阿昔洛韦、伐昔洛韦、更昔洛韦等。局部也可以外擦抗病毒的药膏，比如阿昔洛韦软膏、喷昔洛韦乳膏、干扰素凝胶等。如果水泡破溃，可以外用莫匹罗星软膏、夫西地酸软膏预防感染。龟头部的水泡还可能有其他的原因，包括像药物引起的固定性药疹，也可以在龟头部位引起水泡。有时候昆虫叮咬局部，也可引起水泡，这些都要针对病因进行相应的处理。