可以采用保守治疗以及手术治疗这两种方法治疗肛窦炎。肛窦炎治疗应该根据患者的患病情况有针对地选择治疗方案，如果患者临床症状体征并不严重可以选择保守治疗的方案处理肛窦炎。在治疗过程中可以采用坐浴的方式使用温盐水进行肛门处的清洁工作，患者在治疗过程中需要重视清洁工作，除此之外还应该结合药物联合治疗，这样能够在很大程度上缓解肛窦炎为机体带来的不良影响。在保守治疗期间服食一些抗生素能够有效地提升治疗的效果。对于肛窦炎临床症状体征严重的患者，需要尽快安排进行手术治疗，在手术之后需要关注患者的恢复情况，同时还需要让患者注重养病期间肛门处的清洁工作，否则会直接影响到手术的效果，患者在休养期间还可以服食抗生素，这样能够有效地控制残余感染并避免因大便干燥带来的不良影响。