分公司分为独立核算的分公司和非独立核算的分公司，无论是独立核算还是非独立核算的分公司只要是有独立经营的业务，都应该设立独立的会计核算帐套，非独立核算的分公司是为了便于经营管理，独立核算是税收征管法的要求。独立核算、非独立核算的区别主要在企业所得税的计算上，独立核算分公司在分公司汇算清缴企业所得税，非独立核算分公司在总公司汇算清缴企业所得税。