泌尿系结石形成的原因是尿液中的钙盐过量的结晶析出，一部分是代谢因素，有些患者会有高钙血症，或者高尿酸血症的问题，会容易出现尿液中钙盐过量析出。另外，还有一些局部病因，比如有泌尿系感染，或者有泌尿系梗阻，甚至有些病人还会有泌尿系统的异物存在，这些问题也都会诱发结石的发生和形成。此外，长期口服一些特殊的药品，比如氨苯蝶啶这样的药品或者环胺类药品，还有个别病人长期吃激素如皮质醇激素，从而出现结石。