男性尿道痛的原因如下：1.尿道炎，比如普通细菌感染或者是淋球菌、支原体、衣原体等特殊细菌感染尿道后均会引起尿道炎，就可导致尿道刺痛、尿道瘙痒、排尿频繁等症状。在确诊后应及时地使用抗生素类药物治疗，避免感染加重。2.前列腺炎，在患有前列腺炎疾病后会导致后尿道的压力增加，就可引起排尿疼痛、腹股沟疼痛等症状，一般还伴有尿滴白、尿分叉等症状。3.尿道结石，当男性的尿道中存在结石时会导致尿道损伤，也会引起尿道疼痛，并且还伴有轻度的血尿。