因念珠菌感染部位、方式和严重程度不同，患者自身免疫力不同，病原治疗时选择药物，用药方式和疗程也不尽相同。应根据患念珠菌病的部位和感染念珠菌的菌种，患者的基础病和危险因素以及药物的抗真菌作用、药动学和药效学的特点，选用优化给药方案进行抗真菌治疗。一般的治疗要注意休息和个人卫生习惯，去除诱因，免疫力低下的患者应尽快就诊，大面积烧伤患者应尽快促进伤口愈合，避免长时间暴露。导管相关性念珠菌感染，如念珠菌尿路感染的患者，建议更换和拔除导尿管。治疗的原则就是根据患者个体的差异，选择合理的给药方式，主要包括局部用药和全身用药。局部用药适用于部分皮肤和粘膜念珠菌病，可将抗念珠菌的药物、软膏、霜剂涂于病变的皮肤粘膜，也可将栓剂、洗剂等用于患病的泌尿生殖道；全身用药，适用于局部用药没有效果的皮肤、粘膜念珠菌病和部分粘膜系统性念珠菌病。