奥美拉唑肠溶片的主要的不良反应包括有口干，腹胀，恶心，呕吐，腹泻，便秘，腹痛等等。还可能会出现肝功能的轻度异常，表现为转氨酶的轻度增高，一般情况下，转氨酶的增高为一过性的增高，停药以后转氨酶能够比较快的降到正常。同时，还可能出现神经系统的一些表现，比如出现有感觉异常，头痛，头晕，嗜睡，失眠以及内分泌系统的表现，可以出现维生素b12的缺乏。对于奥美拉唑出现过敏的患者，还可能出现有皮疹，甚至出现严重的溶血性贫血等等。