子宫颈腺囊肿通常无症状，只是在妇科检查时发现。绝大多数情况下是子宫颈的生理性变化，无需治疗。子宫颈转化区内鳞状上皮取代柱状上皮过程中，新生的鳞状上皮覆盖子宫颈腺管口或伸入腺管，将腺管口阻塞，导致腺体分泌物引流受阻，潴留形成囊肿。子宫颈局部损伤或子宫颈慢性炎症，使腺管口狭窄也可导致子宫颈腺囊肿，形成子宫颈腺囊肿。通常无需治疗，但深部的子宫颈腺囊肿，子宫颈表面无异常，表现为子宫颈肥大，应该与子宫颈腺癌鉴别。