胃肠功能紊乱首先明确病因，针对病因治疗。导致胃肠功能紊乱的相关疾病有功能性消化不良、肠易激综合征、功能性便秘等，药物包括促胃肠动力药、抑酸药、调节肠道菌群药、止泻药等，如多潘立酮、益生菌、乳果糖。病因不同，药物选择也不同。中医认为胃肠功能紊乱可以表现为泄泻、便秘、痞满、腹痛等，辨证分型有肝胃不和、饮食阻滞、湿热内阻和脾胃虚弱等证，视证型可选用越鞠丸、保和丸、清中汤、六君子汤等不同的方药。此外，针灸足三里、中脘、天枢等穴位，经常按摩腹部对促进胃肠道运动，调节胃肠功能也有良好的疗效。