咳嗽引起头疼可选择以下的方式进行治疗：首先，如果是轻度的咳嗽，不需要口服止咳的药物，建议患者多饮水，多食一些新鲜的蔬菜和水果，有助于体内毒素的排泄。如果频繁咳嗽引起头疼的时候，建议检查血常规。如果考虑是细菌感染，应立即给予敏感抗生素进行抗感染治疗。咳嗽严重的可口服一些止咳的药物，例如复方甘草片、复方甲氧那明等药物。如果患者伴有较多的痰液排不出，应口服氨溴索口服液、羧甲司坦口服液等药物。头痛严重的可口服对乙酰氨基酚、尼美舒利等非甾体类的药物抗炎止痛。