治疗小孩消化不良的药物，主要就是应用一些小儿健胃消食片等进行调理治疗，同时也可以适当的应用一些山楂丸，或者是选择应用一些调理胃肠功能紊乱的益生菌，例如妈咪爱或者是合生元等进行调理治疗。同时也可以外用一些治疗胃肠功能紊乱的肚脐贴等进行调理。重要的是做好饮食方面的调理，尽量少量多餐，不吃任何刺激性的食物，不要吃太硬的食物，才有利于病情的恢复。