盆腔囊肿有多种性质，其中比较常见的包括卵巢滤泡囊肿和黄体囊肿、输卵管卵巢囊肿、卵巢巧克力囊肿和皮样囊肿等。每种囊肿所形成的原因不一样，其中卵巢滤泡囊肿和黄体囊肿是跟排卵相关的囊肿，一般属于生理性的囊肿，大多数观察两三个月可以自行消失。输卵管卵巢囊肿是因为盆腔炎性疾病后遗症导致的包裹性积液，可能曾经有腹痛的病史。卵巢巧克力囊肿是因为子宫内膜异位到卵巢，随着月经周期的变化而形成的囊肿。皮样囊肿，也就是畸胎瘤，是属于肿瘤类的疾病，绝大多数都属于良性，但是也有2%的恶变的概率，肿瘤的发病原因并不是特别的清楚。