不同的妇科疾病有不同的病因，妇科疾病是一个比较广泛的概念，包括妇科的炎症性疾病、性传播疾病、月经不调类疾病、妇科肿瘤类疾病、不孕不育症等类别。炎症类的疾病，包括宫颈炎、阴道炎、盆腔炎、子宫内膜炎等，多数是由于细菌或病毒的感染导致的。性病，包括尖锐湿疣、梅毒、生殖器疱疹、淋病、艾滋病等，主要是由于不洁性生活史以及病毒感染所导致的。月经不调内疾病可由于卵巢相关的疾病，内分泌相关的疾病等导致。不孕不育症主要的原因有内分泌性的不孕，子宫性的不孕，输卵管性的不孕等。妇科肿瘤类疾病可能的相关原因有遗传因素、免疫因素等。