引起子宫内膜异位症的病因有三种说法：第一、种植学说，因经血逆流引起。是由于子宫内膜腺上皮及间质细胞，可随经血逆流经输卵管进入盆腔，引起淋巴及静脉的播散。子宫内膜也可以通过淋巴和静脉向远处播散，导致医源性种植。剖宫产后腹部切口或分娩后，会阴切口发生内异症。第二、体腔上皮化生学说，认为卵巢表面的上皮。盆腔腹膜，均由胚胎期具有高度分化潜能的体腔上皮分化而来。第三、诱导学说，认为未分化的腹膜组织，在内源性生物化学因素的诱导下，也发展成为子宫内膜组织，而引起子宫内膜异位症的发生。