肠胃炎低烧头疼的患者应该及时到当地医院的消化科进行检查，在医生的指导下服用治疗肠胃炎的药物帮助患者改善病情，如果头疼的情况比较严重，就有必要服用止痛药，同时要注意监测体温，适当地通过物理方式使体温恢复正常。如果温度持续升高，超过38.5℃就要及时向医生反馈，在医生的指导下服用退烧药物进行治疗。患者在此期间要注意休息，尽量多卧床睡觉，饮食宜选择低盐、低脂的清淡口味食物，不要吃过于干硬的油炸、烧烤、过于辛辣的食物。