安宫牛黄丸具有清热解毒、镇惊开窍的功效，但是安宫牛黄丸如果使用不当，可能会导致副作用，如体温过低、过敏反应等。如出现肢寒畏冷，面色苍白，冷汗不止，脉微欲绝应立即停药，采用应急综合疗法。另外，安宫牛黄丸中含朱砂、雄黄，不宜过量或长期服用，否则会引起慢性中毒。安宫牛黄丸可用于治疗热病、邪入心包、高热惊厥、神昏谵语、中风昏迷等，缓解高热烦躁、惊厥抽搐、昏迷、不省人事、牙关紧闭、面赤气粗、口舌歪斜、头痛咳嗽、喉间痰鸣等症状；脑炎、脑膜炎、中毒性脑病、脑出血、败血症、脑梗死、脑出血患者，出现以上症状时也可以使用安宫牛黄丸。安宫牛黄丸还可用于颅脑损伤、重型肝炎、肺性脑病所见高热、神昏的治疗。现代药理研究发现，安宫牛黄丸还具有镇静、解热、抗炎、保肝、保护脑组织、抗肿瘤等作用。