新生儿血管瘤形成的原因到目前为止还不清楚。血管瘤和血管畸形实际上是一种脉管发育异常，在病理学上属于错构瘤，而非真性的肿瘤，虽然发病机理不清楚，但是有两个学说在国际上广泛共识。第一、胚胎残留学说，造血干细胞分化形成血管内皮细胞，血管内皮细胞在生长因子的刺激下形成新的血管芽，继而形成血管瘤的瘤体。第二、雌激素学说，研究表明血管瘤患者血清中，雌二醇的含量明显要高于正常同龄儿童，所以怀疑和雌激素有一定的关系。