可以做一些尿道分泌物的涂片，或者是尿三杯试验。尿道分泌物涂片，可在多核白细胞内找到成对排列的革兰阴性双球菌，在慢性期淋病奈瑟菌潜藏于腺、窦及前列腺等处，因而不易发现。尿三杯试验以第一杯脓尿最为明显。非淋菌性尿道炎一般也是去尿三杯试验，清晨排尿前取尿道分泌物，做衣原体、支原体接种培养，非淋菌性尿道炎与淋菌性尿道炎，可以在同一病人同一时期中发生双重感染。因症状相似，鉴别诊断尤为重要。尿道分泌物涂片，每高倍镜视野下可以见到10~15个多核白细胞，找到衣原体或支原体包含体，如细胞内革兰阴性双球菌，据此可以与淋菌性尿道炎相鉴别。