对于乙胺丁醇的副作用，发生率较多的是眼部的副作用，临床上称为视神经炎，这种副作用在常规剂量的时候很少发生，但是当每日剂量过大的时候，在用药后2-6个月可能会出现视力模糊、眼痛、红绿色盲，或者视力减退、视野缩小，这都是视神经炎的表现，剂量过大是指每天按体重计算剂量达到25mg/kg以上，这种视神经炎可以发生在单侧眼，也可以发生在双侧眼。对于发生率较少的副作用，主要累及在关节，可能会出现畏寒、关节的肿痛，尤其是在大拇指、脚踝和膝关节，在病变关节的表面皮肤可能会有发热和拉紧感，对于这种关节的副作用，痛风和高尿酸血症的患者更容易发生。极少数患者会发生过敏反应和周围神经炎，过敏表现为皮疹、发热、关节痛等，周围神经炎主要表现为麻木、针刺感、烧灼感或者手足软弱无力。