治疗败血症的药物要根据引起败血症的不同的致病菌进行选择。如果是细菌导致的败血症，常用的药物有头孢类抗生素、青霉素类抗生素、喹诺酮类或者氨基糖苷类抗生素，有些患者需要联合使用抗生素。如果患者是由金黄色葡萄球菌感染所导致的感染，需要使用去甲万古霉素。如果是由真菌导致的败血症，需要使用抗真菌药物，包括氟康唑、伊曲康唑、伏立康唑、两性霉素B等。如果败血症的患者出现感染性的休克，还需要使用去甲肾上腺素、多巴胺、多巴酚丁胺、血管加压素来维持血压。