吗啉硝唑氯化钠针主要是用于治疗或者预防，已经被证实或者是疑似易感菌引起的感染。主要用于敏感菌引起的成年人发生的感染，比如妇科的盆腔炎。还可以应用联合手术，治疗化脓性阑尾炎和坏疽型的阑尾炎。必须注意的是吗啉硝唑氯化钠只能用于年满18周岁的成年人，儿童是不能应用的。不能够应用于造血功能低下、慢性酒精中毒、癫痫和各种器官硬化症的患者，不能用于对硝基咪唑类药物过敏的患者。