小便时尿道口有疼痛感，出现这种症状常见的病因是尿路感染。医生可以进行查体，看看有没有尿道口流脓，同时看患者有没有尿频、尿急的症状，有没有不洁性生活的病史。如果这些都没有，那考虑就是单纯的尿路感染引起来的，可以通过尿常规来进行检查。如果尿常规当中白细胞是明显的升高的，那提示是有尿路感染。治疗方面，可以通过口服抗生素来进行治疗，常用的抗生素是头孢或者是左氧氟沙星，一般治疗一周左右症状就能够明显的缓解。